События 11-ого фильма разворачиваются на острове Коми, расположенном в Тихом океане. Здесь испокон веков передается легенда о "Подводном дворце", древних руинах на дне моря, где, по преданию, спрятаны сокровища двух знаменитых женщин-пиратов - Энн Бонни и Мэри Рид, живших 300 лет назад. Находясь в отпуске на этом загадочном острове, Когоро, Конан, Ран и их друзья из "Команды юных детективов" сталкиваются с группой охотников за сокровищами. Вскоре они оказываются втянуты в опасные преступления и захватывающие поиски потерянного богатства. Весьма загадочные и непредсказуемые события вынуждают героев раскрывать тайны прошлого и сражаться за свою жизнь, в то время как прошлое и настоящее переплетаются в роковой паутине интриг и опасностей. Им предстоит исследовать подземные пещеры, расшифровывать коды и головоломки, чтобы раскрыть тайну "Подводного дворца" и победить злодеев, стремящихся завладеть сокровищами. Каждый новый шаг приближает героев к решению головоломки, но также увеличивает опасность их задачи. В этом захватывающем приключении друзья узнают о силе дружбы, умении доверять друг другу и смелости действовать в сложных ситуациях.