Три года прошли с тех пор, как закончились события известного аниме "Приключения Дигимонов 02". Главные персонажи, Тай и Мэт, столкнулись с трудностями типичными для подростков - проблемы в дружбе, любви и учебе. Их отношения стали более сложными, они отдаляются друг от друга. Но внезапно в их жизни появляется Мими из Америки. В это время зловещий Дигимон нападает на город, и только появление Агумона спасает Тай и его друзей. Оказывается, что некоторые Дигимоны в цифровом мире заражены и нуждаются в помощи. Теперь все Дигимоны-партнеры возвращаются к своим детям, чтобы защитить оба мира от новой угрозы. Герои ощущают тяжесть ответственности и страх перед неизвестным. Новый избранный ребенок вызывает дополнительные проблемы, добавляя напряжения и сложностей в уже непростую ситуацию. Несмотря на радость встречи со старыми друзьями, героям предстоит преодолеть множество испытаний и трудностей, чтобы спасти оба мира от опасности.