События второго сезона аниме начинаются непосредственно после событий, произошедших в арке «Феникс Цукихи». Главный герой, Арараги Коёми, пережил немало испытаний за последние полгода. Его тело было разорвано на части, его кровь была попросту выпита, его имя и репутация были поклеваны, его обвинили в извращенстве и лоликонстве. Но самые главные трудности только набирают обороты! На личном фронте у него полный хаос. Его подруга Сэндзёгахара Хитаги начала себя вести странно - она дразнит его любовными прозвищами, шлет множество смайлов в SMS-сообщениях и ведет себя как-то слишком радостно. Арараги не понимает, как ему на все это реагировать. Где же исчезли её обычная холодность и ядовитые насмешки? Но и наслаждаться повседневной жизнью у Арараги не приходится. Невыполненная домашняя работа летом приводит к зомби-апокалипсису, а его друзья снова попадают в опасные ситуации с мистическими существами. И конечно, кому-то же придется прийти на помощь, рискуя собственной жизнью. И кто же это будет, если не сам Арараги-сэмпай, братик Коёми, Арараги-кун. На этот раз в аниме экранизированы пять из шести новелл второго сезона: Shiro, Kabukimonogatari, Otorimonogatari, Onimonogatari & Koimonogatari.
